Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms