Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CARD11Q9BXL7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARD11Q9BXL7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms