Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FNDC11Q9BVV2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC11Q9BVV2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms