Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3CQ9BUI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3CQ9BUI4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms