Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU79

TMEM243, Transmembrane protein 243, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM243Q9BU79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM243Q9BU79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM243Q9BU79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms