Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHCHD5Q9BSY4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD5Q9BSY4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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