Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGMATQ9BSE5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGMATQ9BSE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AGMATQ9BSE5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGMATQ9BSE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms