Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH2D3AQ9BRG2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms