Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN3Q9BQT9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms