Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VGLL1Q99990 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VGLL1Q99990 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms