Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPNE1Q99829 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms