Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF18Q99633 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF18Q99633 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF18Q99633 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms