Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHOX2BQ99453 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHOX2BQ99453 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms