Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3RQ99062 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF3RQ99062 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms