Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEBP4Q96S96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEBP4Q96S96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms