Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACCSQ96QU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACCSQ96QU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms