Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSPG4P5Q96PW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSPG4P5Q96PW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms