Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF3Q96PU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF3Q96PU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms