Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ1

SIGLEC12, Sialic acid-binding Ig-like lectin 12, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGLEC12Q96PQ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIGLEC12Q96PQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIGLEC12Q96PQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms