Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP57Q96MR6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms