Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74BQ96LY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC74BQ96LY2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms