Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNPC3Q96LT9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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