Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOLD1Q96LR9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOLD1Q96LR9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOLD1Q96LR9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms