Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC22AQ96IW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22AQ96IW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms