Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM3Q96HU1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms