Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT43Q96FT9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT43Q96FT9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT43Q96FT9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms