Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD3Q96ES6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms