Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GCC1Q96CN9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms