Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM4SF18Q96CE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms