Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAVIN3Q969G5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN3Q969G5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms