Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C6Q969F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C6Q969F1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C6Q969F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
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