Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB1CQ92928 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB1CQ92928 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms