Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC1Q92574 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms