Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMO7Q8WWI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMO7Q8WWI1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms