Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DEPDC1BQ8WUY9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1BQ8WUY9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms