Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP1Q8TDR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms