Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A3Q8NEV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A3Q8NEV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms