Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms