Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLIS3Q8NEA6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLIS3Q8NEA6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms