Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9T8

KRI1, Protein KRI1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRI1Q8N9T8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRI1Q8N9T8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRI1Q8N9T8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms