Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAF1Q8N7H5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAF1Q8N7H5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms