Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms