Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms