Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSL3Q8N5Y2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms