Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE1Q8N0S2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1Q8N0S2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms