Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT1Q8IXI2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms