Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN4BQ8IWT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN4BQ8IWT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms