Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms