Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PBRM1Q86U86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PBRM1Q86U86 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms