Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDB1Q86U70 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDB1Q86U70 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms